1963 թվականին Սինգապուրը միացավ Մալաիյան դաշնության,հյուսիսային Բորնեոյի ու Սարավակոյի հետ և ստեղծվեց Մալազիա պետությունը:Միությունը երջանիկ չէր և ոչ երկարատև:

Սինգապուրի և Մալազիայի կառավարության

 միջև շատ գաղափարական տարբերություններ կային,որը արդյունքում բերեց տարաձայնությունների տնտեսական,ֆինանսական և սոցիալական քաղաքականության մեջ:

   1964թ-ին տեղի ունեցած խռովություններից հետո,նոր խռովությունները կանխելու նպատակով,1965թ-ի 

օգոստոսի 7-ին ,պառլամենտի միաձայն որոշմամբ,Սինգապուրը հեռացվեց Մալազիայից:Լի Կուան Յուն արցունքները աչքերին հայտարարեց Սինգապուրի անկախության մասին ասելով. «Սա իմ կյանքի ամենատխուր պահն է:Ես հավատում էի,որ երկու պետություն կարող են դառնալ  միասնական»:

Այդ օրը Սինգապուրը դարձավ միակ պետությունը,որը անկախություն էր ստացել հակառակ իր կամքին:Նոր պետությունը կոչվեց Սինգապուրի Հանրապետություն,իսկ նրա նախագահը դարձավ Յան դի-Պերտուան Նեգարան: